Vor nicht allzu langer Zeit bestätigte Lily Vachovski die Theorie, die bei Fans beliebt ist, dass die Matrix-Trilogie eine Allegorie für das Leben von Transgender ist:
Ich bin froh, dass es sich herausstellte, dass es unsere erste Idee war. Was die Leute über "Matrizen" als Filme über die Transformation sprechen. Diese Filme sind für den Transgender sinnvoll, sie eignen sich für mich und sagen: "Diese Filme retteten mein Leben." Denn wenn Sie über die Transformation in der Welt der Science-Fiction sprechen, ist es nur das Fantasie der Fantasie und die Idee, dass es unmöglich ist, möglich zu sein. Deshalb sind diese Filme so viele für sie.
In einem Interview mit Yahoo Entertainment, das Keanu Rivz anlässlich des Austritts der lang erwarteten Fortsetzung von Bill und Ted gab, fragte der Schauspieler, ob er von diesen Bedeutungen der "Matrix" wusste. Er antwortete:
Ich habe nie mit Lilie darüber gesprochen. Sie erklärte nicht so etwas. Ich denke, dass alle Filme "Matrix" sehr tief sind, und andere Leute können verschiedene Allegorien in sie investieren. Aber cool, dass Lily uns all das erzählte.
Auf die Frage, ob der Film "Matrix 4" arbeitet, an dem sie fortfahren, auch ein Film über Transgender, Rivz lachte und sagte:
Ich weiß nicht. Ich denke, dass der neue Film wieder für Interpretationen eröffnet wird.