Hace tanto tiempo, Lily Vachovski confirmó la teoría popular entre los fanáticos de que la matriz trilogía es una alegoría de la vida de transgénero:
Me alegro de que resultó que fue nuestra idea inicial. Lo que la gente habla de "matrices" como películas sobre la transformación. Estas películas son significativas para el transgénero, son adecuados para mí y dicen: "Estas películas salvaron mi vida". Porque cuando hablas de transformación en el mundo de la ciencia ficción, es solo el juego de la imaginación y la idea de que es imposible ser posible. Es por eso que estas películas son tantas para ellos significan.
En una entrevista con Yahoo Entertainment, que Keanu Rivz dio con motivo de la salida de la esperada y esperada continua de Bill y Ted, el actor le preguntó si sabía sobre estos significados de la "matriz". Respondió:
Nunca hablé de eso con Lily. Ella no explicó nada de eso. Creo que todas las películas "Matrix" son muy profundas y diferentes pueden invertir diferentes alegorías en ellos. Pero genial que Lily nos contó todo esto.
A la pregunta, si la película "Matrix 4" trabajará en la que continúan, también una película sobre transgénero, RIVZ se rió y dijo:
No sé. Creo que la nueva película se abrirá de nuevo para las interpretaciones.