Non hai moito tempo, Lily Vachovski confirmou a teoría popular entre os fanáticos que a trilogía matricial é unha alegoría para a vida do transgénero:
Alégrome de que resultará que era a nosa idea inicial. O que a xente fala de "matrices" como películas sobre a transformación. Estas películas son significativas para o transgénero, son axeitadas para min e din: "Estas películas salvaron a miña vida". Porque cando falas de transformación no mundo da ciencia ficción, é só o xogo de imaxinación e a idea de que é imposible ser posible. É por iso que estas películas son tantos para eles significan.
Nunha entrevista con Yahoo Entertainment, que Keanu Rivz deu con motivo da saída da tan esperada continuación do proxecto de lei e Ted, o actor preguntou se sabía sobre estes significados da "Matrix". El respondeu:
Nunca falei diso con Lily. Non explicou nada así. Creo que todas as películas "Matrix" son moi profundas e as persoas diferentes poden investir diferentes alegorías neles. Pero cool que Lily díxonos todo isto.
Á pregunta se a película "Matrix 4" estará traballando na que continúan, tamén unha película sobre Transgender, Rivz riu e dixo:
Non sei. Creo que a nova película será aberta de novo para interpretacións.