Non molto tempo fa, Lily Vachovski ha confermato la teoria popolare con i fan che la trilogia della matrice è un'allegoria per la vita di Transgender:
Sono contento che si sia scoperto che era la nostra idea iniziale. Quali persone parlano delle "matrici" come film sulla trasformazione. Questi film sono significativi per Transgender, sono adatti a me e dicono: "Questi film hanno salvato la mia vita". Perché quando parli di trasformazione nel mondo della fantascienza, è solo il gioco dell'immaginazione e l'idea che sia impossibile essere possibili. Ecco perché questi film sono così tanti per loro significano.
In un'intervista con Yahoo Entertainment, che Keanu Rivz ha dato in occasione dell'uscita della lunga continuazione del Bill e Ted, l'attore ha chiesto se conosceva questi significati della "matrice". Lui ha risposto:
Non ne ho mai parlato con Lily. Non ha spiegato nulla del genere. Penso che tutti i film "Matrix" siano molto profondi e persone diverse possono investire diverse allegorie in essi. Ma fresco che Lily ci ha detto tutto questo.
Alla domanda se il film "Matrix 4" lavorerà su cui continueranno, anche un film su Transgender, Rivz rise e disse:
Non lo so. Penso che il nuovo film sarà nuovamente aperto per le interpretazioni.