Eccleston se bori z anoreksijo in razčlenjevanjem - duševno motnjo, zaradi katere je oseba prepričana, da ima določeno telesno napako. Pravzaprav je namišljen, vendar so ljudje s takšno boleznijo nagnjeni k hudi depresiji in zaprtju.
Ljudje, kot je, kot pogledam v seriji, vendar v tem trenutku sem bil zelo bolan. Posebna nagrada za to bolezen. Vedno sem mislil na svojo umazano skrivnost, ker sem iz severa, sem človek, in jaz sem iz preproste delovne družine,
- Objavljeno s 55-letnim igralcem.
V letu 2015 so razmere s psiche Eccleston poslabšale razvezo, po katerem je celo poskušal uvesti na njegove roke, vendar v času je določil v specializirani kliniki.
Na ta dan sedim na antidepresive. Seveda bi rad zmanjšal odmerek, da se izkaže, da je v resničnem svetu. In vendar je smešno, da je moje življenje postalo veliko boljše, ko sem začel jemati tablete,
- je dejal Christopher.
Spomnimo se, da je Eccleston pojavil v samo 13 epizodah serije "Doctor, ki". Po mnenju igralca se je zaradi bolezni občutil zelo negotovo, zato so proizvajalci izgubili vero v njega.