Hindi pa matagal na ang nakalipas, kinumpirma ni Lily Vachovski ang teorya na sikat sa mga tagahanga na ang trilohiya ng matrix ay isang alegorya para sa buhay ng transgender:
Natutuwa akong naka-out na ito ang aming unang ideya. Ano ang pinag-uusapan ng mga tao tungkol sa "matrices" bilang mga pelikula tungkol sa pagbabagong-anyo. Ang mga pelikulang ito ay makabuluhan para sa transgender, angkop ang mga ito para sa akin at sabihin: "Iniligtas ng mga pelikulang ito ang buhay ko." Dahil kapag nakikipag-usap ka tungkol sa pagbabagong-anyo sa mundo ng science fiction, ito ay lamang ang laro ng imahinasyon at ang ideya na imposible na maging posible. Iyon ang dahilan kung bakit ang mga pelikulang ito ay napakarami para sa kanila.
Sa isang pakikipanayam sa Yahoo Entertainment, na ibinigay ng Keanu Rivz sa okasyon ng exit ng pinakahihintay na pagpapatuloy ng Bill at Ted, tinanong ng aktor kung alam niya ang tungkol sa mga kahulugan ng "Matrix". Tumugon siya:
Hindi ko sinalita tungkol dito sa liryo. Hindi niya ipinaliwanag ang anumang bagay na tulad nito. Sa tingin ko na ang lahat ng mga pelikula "Matrix" ay masyadong malalim at iba't ibang mga tao ay maaaring mamuhunan ng iba't ibang mga allegories sa kanila. Ngunit palamig na sinabi ni Lily sa amin ang lahat ng ito.
Sa tanong kung ang pelikula na "Matrix 4" ay nagtatrabaho kung saan sila magpatuloy, isang pelikula tungkol sa transgender, Rivz laughed at sinabi:
Hindi ko alam. Sa tingin ko na ang bagong pelikula ay muling mabubuksan para sa mga interpretasyon.