У 2018 році Юен МакГрегор розлучився зі своєю дружиною Ів Мавракіс - художницею, з якою актор прожив 22 роки і виховав чотирьох дочок. В якості причини розлучення МакГрегор вказав «непримиренні розбіжності».
Зараз Юен складається у відносинах з актрисою Мері Елізабет Уінстед, колегою по серіалу «Фарго». Про відносини з Мері стало відомо приблизно в той же час, коли всі дізналися про розлучення МакГрегора.
В інтерв'ю Men's Journal Юену поставили запитання, як він почувається зараз, і стало йому легше в нових відносинах.
Так, зараз мені краще. Я дійсно став щасливішим,
- коротко відповів МакГрегор.
Як відомо, зміна партнерів Евана виявилася дуже болючою для його родини. Старша дочка МакГрегора Клара відверто не злюбила Мері Елізабет Уінстед. Одного разу вона прокоментувала її фотографію з церемонії вручення премії Vanity Fair в Instagram:
Найкрасивіша і талановита жінка на Землі ?! Господи, та ви марите. Вона ж просто шматок сміття.
Також Клара деякий час злилася на батька за те, що він кинув її маму. Про це вона також висловлювалася в соцмережі. Однак пізніше Клара вибачилася перед батьком і сказала, що «все одно любить його».