У 2011 році, незабаром після закінчення зйомок першого сезону «Ігри престолів», Емілія Кларк перенесла інсульт внаслідок розриву аневризми головного мозку. Актриса була буквально за крок від смерті, але, на щастя, екстрена операція і подальша реабілітація допомогли їй подолати страшну недугу. Правда, довгий час Кларк тримала цей інцидент в таємниці. Вперше вона повідала про це лише вісім місяців тому в інтерв'ю The New Yorker. Повернувшись до цієї теми під час запису подкасту Table Manners, актриса зізналася, що про свою хворобу вона не розповідала навіть продюсерам «Ігри престолів», боячись, що її позбавлять ролі Дейнеріс Таргаріен.
Я не могла відкрити їм всі деталі події до тих пір, поки не стало відомо, що я не помру. Так що протягом трьох тижнів я могла лише говорити щось на кшталт: «Вибачте, що не відповіла на ваші старі електронні листи. Мені трохи нездужає останнім часом ... Але в цілому я в порядку! ». До слова, зараз я вже повністю здорова. Все відмінно. Я знову повернуся до роботи, ніщо мені більше не завадить. Я відчуваю себе чудово. Я дуже боялася, що мене можуть з тієї чи іншої причини звільнити. Так що я немов би залишилася наодинці з собою. Я не знала, що насправді мною дуже дорожать,
- сказала Кларк.
Варто додати, що пізніше, вже оговтавшись від недуги, Кларк взяла участь в створенні благодійного фонду по боротьбі з хворобами головного мозку.